學甲公所因財政窘迫，傳出11、12月薪水沒有發放，此情形在12月25日新任區長就職典禮時，由新任學甲區長邱志榮向財政處代理處長張紹源提出，並轉呈台南市長賴清德知悉，賴清德市長獲悉後甚為震驚，並指示財政處立即處理。

學甲公所於今(99)年9月即出現財政窘迫的現象，9、10月份薪水已沒有如期發放，而11、12月則是沒有發放，然而學甲公所於狀況發生之初，並未向當時的台南縣政府呈報，縣府無從知悉，也未聽到任何公所員工反應此事。

新任學甲區長於12月25日發布後，邱區長於就職典禮會場向財政處代理處長張紹源提及此事，尋求協助，張代理處長認為茲事體大，所以在12月26日市府首長策勵營研討會上將問題提出，副市長顏純左與祕書長陳美伶裁示應給予協助，並轉呈賴市長。賴市長獲悉後甚為震驚，指示財政處立刻協助解決。今(27)日賴市長於視察財政處辦公室時，也再度表達關心。

市府財政處已電告學甲區公所，立即將需求函報市府，俟市長核定後，即辦理撥款，解決員工生活之所需。而邱區長已親自於今(27)日下午將求援助之公函送達市府，財政處立即簽報賴市長，賴市長已於今日下午巡視後核定。