南瑪都颱風登陸後轉為輕颱，氣象局特別提醒南部地區，應持續注意南瑪都挾帶的豐沛雨量。嘉義市南瑪都颱風應變中心，29日上午召開第二次工作會議，指揮官市長黃敏惠表示，南瑪都雖轉為輕颱，仍不可掉以輕心，她特別指示里政、社政及警消等單位，應做好低窪地區宣導及各項避難收容準備，另外，五河局堤防工程，更應加強防範措施，防阻任何可能災情。
截至29日下午4時，應變中心共接獲災情通報一案，內容為29日上午9時民眾通報紅瓦里農田排水溝沙包阻塞排水，環保局已迅速排除。消防局表示，氣象局預測，南部山區及平地有機會出現局部大豪雨或超大豪雨，應監控八掌溪及牛稠溪水位，隨時做好避難收容準備。後指部黃繼偉指揮官與會表示，軍方人力及機具車輛已整備完成，市府若有任何需求，將全力協助。