內政部於98年5月底核定台南縣環保科技園區實驗廠房大樓通過綠建築標章申請案，以永續生態、節能、減廢、低污染、舒適、健康、環保理念設計興建完成，並於98年3月30日開始辦理申請綠建築標章相關作業，業經內政部委辦單位-財團法人台灣建築中心審查。

縣府為配合地方產業發展需求及廠商用地之慇切，並考量工業區生態化建設的國際趨勢，經一向重視環保生態的縣長蘇煥智，爭取在原大新營工業區即現今的柳營科技工業區設置環保科技園區，並於92年11月獲得行政院環保署核定通過以大新營工業區內部分土地提出「環保科技園區設置計畫」，且為服務整體區廠商及提供研究空間，特斥資新台幣5億3,975萬元於園區內興建管理研究大樓及實驗廠房大樓，整體規劃設計以符合綠化量指標、水資源指標、日常節能指標、二氧化碳減量指標、廢棄物減量指標、污水垃圾改善指標、生物多樣性指標、室內環境指標與基地保水指標為主，工程施工部分經縣府各單位及相關廠商之努力下已興建完成，並依相關規定於97年3月30日開始申請綠建築標章，經多次審查之後，內政部於98年5月13日核定通過本大樓綠建築標章申請案，本標章顯示本府致力推動綠建築作業上不遺餘力。

本次綠建築標章指標中說明為：1、綠化量指標：植栽數量多故基地內綠化量良好。2、水資源指標：因設置雨水回收系統用於澆灌景觀植栽及廁所沖水設備，且用水器均為省水標章產品。3、日常節能指標：建築外設置深陽台、格子梁柱框等遮陽設施，屋頂隔熱良好；照明設備採用電子式安定器之螢光燈具。4、二氧化碳減量指標：建材使用輕量化隔間材及再生建材。5、廢棄物減量指標：採用營建自動化工法乾式隔間、基地土方平衡及減少對環境衝擊之工法。6、污水垃圾改善指標：污水均經污水處理設施處理後再排出；於地下室設置資源回收室及垃圾收集室提供良好資源垃圾分類回收系統。7、生物多樣性指標：植栽多種類、多層次及高密度且生物共生建築設計。8、室內環境指標：室內之良好之音、光、通風及建材裝修控制良好。9、基地保水指標：基地內均以透水磚鋪設，增加基地保水量。整體評鑑綠建築等級為：銀級（鑽石級：95%以上。黃金級：80%~95%。銀級：60%~80%。銅級：30%~60%。合格級：0%~30%）。