高美濕地雲林莞草區出現水筆仔，因水筆仔會造成濕地硬化，改變雲林莞草區草澤生態，為了維護高美濕地保護區，縣府農業處二十四日開會決議分區清除水筆仔，保護區的水筆仔將予以清除，清水大排之水筆仔，學者專家認為有生態教育功能，大排權責單位為水利署第三河川局，是否採圍籬方式阻絕大排之水筆仔母株繁衍之子代隨潮汐進入保護區，縣府將與第三河川局做進一步研商。

高美濕地雲林莞草區的草澤生態堪稱是高美濕地的特色，也是保護區生態保護標的，但近年來生態學者卻發現高美濕地雲林莞草區陸續出現水筆仔，縣府農業處長期觀察後推測保護區現有之水筆仔應該是由清水大排現有海岸造林之水筆仔母株繁衍之子代經潮汐帶入保護區雲林莞草區塊停留茁壯生長中。

因水筆仔會造成濕地硬化，也會造成草澤生態的改變，為了維護高美濕地保護區，縣府農業處二十四日召開諮詢會議，邀請學者專家針對高美濕地保護區現有紅樹林－水筆仔應該保留或移除進行意見交換。

與會學者專家咸認水筆仔有生態教育的功能，但高美濕地保護區雲林莞草區出現水筆仔，會對該區生態造成破壞，因此可採分區處理，保護區內的水筆仔一律清除，但清水大排之水筆仔可以用圍籬方式阻隔母株繁衍之子代隨潮汐進入保護區，清水大排的水筆仔不清除，可做為日後生態教育之用。

臺中縣政府農業處認同專家學者的建議，決議保護區的水筆仔將予以清除，至於清水大排之水筆仔是否能施作圍籬，因大排出海口權責單位為水利署第三河川局，為此縣府將與第三河川局做進一步研商。