雲林縣政府為促進養殖漁業整體發展，提供養殖漁民完善之經營環境，建立完善養殖漁業管理及產銷體系，並且合理利用水土環境資源，減緩地層下陷，自民國85年起陸續選定原有養殖魚塭集中區域或環境適合水產養殖發展之地區，秉持適地適用原則及當地漁民之配合意願下，先後在口湖地區規劃設立了8個陸上魚塭養殖漁業生產區，總面積高達二千餘公頃，為全國之冠，目前預計將麥寮、台西之魚塭集中區域納入養殖生產區規劃範圍，俾爭取中央政府公共設施建設經費之投入，促進地方發展。
農業處表示，在海域專用漁業權部分，縣府在98年10月下旬即完成雲林區漁會所送專用漁業權申請案件初審程序，同時報請行政院農業委員會漁業署審核，惟迄今仍未獲核定，因此，縣府強烈籲請中央儘速核定海上漁業權，以保障海上養殖業者因天然災害致生損失時，依法能獲得政府救助之美意。