高鐵臺南站自98年4月1日起提供全新「市府線」、「臺南公園線」、「奇美醫院線」及「南科線」4條公車路線接駁服務，據統計資料顯示，截至4月10日各路線共計載運31,873人次，其中市府線載運8,271人次；臺南公園線載運20,984人次；奇美醫院線載運2,247人次；南科線載運371人次。

新路線實施迄今，臺南市政府為提供民眾更為便捷之搭乘服務，經與各單位協商，並獲交通部公路總局嘉義區監理所同意後，決議自4月20日〈星期一〉起調整H31臺南公園線及H32市府線部分站位，「臺南市政府─高鐵臺南站」﹙返程﹚於永華路增設「臺南市政府」第二處下車站，與88路觀光休閒公車「市政中心站」共站。另「臺南市政府─高鐵臺南站」﹙返程﹚「大林新城站」下車站位遷移至大林派出所對面，與5路市區公車「大林站」共站。

交通處特別提醒民眾注意，本次站位調整僅針對自高鐵臺南站返回之「下車站」作調整，往高鐵臺南站方向之上車站位均不變，市政府永華路增設之站位亦僅供下車使用，欲搭乘高鐵快捷公車民眾，仍須至市政中心府前路大門西側候車。

此外，臺南市政府為提供民眾更詳盡之公車到站訊息，已將4條高鐵快捷公車路線納入臺南市公車動態資訊系統監控，且各路線均提供車上站名播報及車頭LED路線顯示服務，另市府線及臺南公園線去程全線站位均建置智慧型站牌(候車亭或直立式站牌)，提供公車即時到站訊息。查詢公車資訊請至臺南市e-bus便民網站http://ebus.tncg.gov.tw或公車語音查詢電話：(06)2998484(我坐坐巴士巴士)。