馬總統愛台12項建設計畫政見中，第六項「產業創新走廊」，將臺東縣深層海水產業計畫列為首要計畫，而由政府投入資金的第一座落腳在台東的「國家水產生物種原庫台東支庫」即將於98年3月31日動工，除了保育水產生物的遺傳資源外，多餘的深層海水也有助於鼎府推動深層海水產業，此外，種原支庫聯外道路之拓寬工程縣府亦已竣工，將有助於工程加速完工。

農委會水試所東部海洋生物研究中心表示，設在台東縣知本地區的國家水產生物種原庫台東支庫，3月31日將開始動工，預定民國100年2月完工，面積6.46公頃，全新設備，總經費新台幣8億5000萬元。

預期啟用後可成為台灣首座深層海水研發基地，帶動海洋生技以及高科技水產養殖產業的發展。未來的工作重點會利用深層海水進行高經濟價值魚介類的育種、優質種苗與藻類的培育及高機能性水產養殖產品、健康美容生技產品及溫控精緻農業技術等研發生技的提昇，並開拓深層海水多元化的產業。

而眾所矚目之「臺東縣深層海水產業發展園區」，除98年10月28日經建會邀集相關單位審查，核定本府以「促進民間參與公共建設(BOT)」方式辦理，公共工程會為表達支持本案，已研妥「促進民間參與公共建設法施行細則」修正草案，將深層海水產業園區納入「重大工業設施」，為本園區增闢適用之法源，於近日內邀集相關單位研議後發布執行。

縣府已完成計畫修訂提報上級爭取園區計畫核定，並與初審單位經濟部水利署達成初步協議，計畫可望於4月中旬召開審查會議，相信在不久的將來「臺東縣深層海水產業發展園區」不再是我們的夢想。

此外，水試所東部海洋生物研究中心表示，未來將依取水狀況，全力協助台東縣政府發展深層海水產業，而「國家水產生物種原庫台東支庫」、「深層海水低溫利用及多目標技術研發模廠」及「臺東縣深層海水產業發展園區」將成為台東縣深層海水發展成為國際深層海水產業的科學重鎮。