機車是台灣目前最普及的交通工具，也是都會地區最主要空氣污染的主要來源。根據統計，目前臺南市內機車數量已超過58萬輛，為有效控管機車對於空氣品質的影響，機車每年定期實施排氣檢驗成為環保局加強管制的重點。98年定檢率100.98%達成管制百分百目標，而定檢站檢驗數量也較97年上升近一萬五千台，連續兩年維持高水準的表現，顯示在市民高度配合的情形下，環保局對於機車污染管制措施上展現卓越的成效。

為有效提升台南市提昇機車到檢率，環保局透過多種方式來宣導與管制，除在各重要路口執行攔查與架設車牌辨識系統稽查以及對路邊停放的車輛進行巡查開立限期到檢通知單外，98年環保局與機車定檢站延續合作關係，機車定檢站認養郵資，由環保局針對臺南市車籍資料庫中篩選未執行定檢之車輛，寄發通知單請車主於限期內完成機車定檢。另外對於稽查後而未實施檢驗之車主，即發文通知車主於期限內完成檢驗，未完成檢驗將告發處分，98年未依規定實施機車定期檢驗共處分568件。此外，環保局亦舉辦『機車定期檢好康獎不完』抽獎活動，凡車籍設臺南市之機車即可參加及安排社區預約定檢服務，期望民眾能將機車定檢觀念深植於心。

目前臺南市內共設有88站機車排氣定檢站，車主可自行選擇就近機車定檢站實施免費定期檢驗，只要出廠滿3年以上的機車，每年需依行車執照的發照月份前後一個月間，主動實施機車排氣檢驗，未實施定期檢驗之車主除了處以新臺幣2,000元之罰鍰外，還將禁止換發行車執照。然而多數車主雖領到通知單，卻容易忘記前往定檢，導致受罰。亦有部分民眾因為擔心機車行照過期會受罰，不敢前往定檢，然而機車排氣檢驗制度與監理所規定是分開管轄，車主不會因行照過期而在定檢時受罰。臺南市環保局提醒民眾，若收到機車定期檢驗通知單，只要依規定完成定檢，就不用擔心受罰的問題，而且機車排氣檢驗完全免費，就像是替愛車進行簡單而免費的健康檢查，不僅確保機車使用壽命，也可一同維護臺南市良好空氣品質。