中科四期二林園區環評審查會議13日在環保署召開，環保署環評專案小組經過冗長的討論後做出建議結論：建議中科四期二林園區環境影響評估有條件（15條）通過審查，並送大會審議。其中初期廢水可就「舊濁水溪」或「濁水溪」之河口進行排放；但雲林縣政府仍堅決反對以任何形式排入濁水溪。
針對20日報載內容，雲林縣政府表示：
（一）針對中科四期基地甄選，各縣市政府均積極參與。彰化縣能獲選，各縣市政府都樂觀其成。
（二）有關中科基地評選確定，並不代表開發單位（中科管理局）可以不顧及環境保護之原則。
（三）中科基地之開發，中科管理局應提出完善之規劃，環保署理應嚴格把關，各盡其責，而非越俎代庖。
（四）雲林縣政府於歷次相關環評會議之發言，均本專業真實發言，無任何政治色彩，有環保署會議紀錄可稽。雲林縣政府反而期待環保署能給環評委員一個獨立審查的空間。
（五）雲林縣政府要求中央政策要明確、透明，不要玩文字遊戲欺騙縣民，且政策決定時不得排除雲林縣政府參與，並期待中央長官能本誠信發言，所說的話並非「政治語言」。