市府辦理「新竹漁港作為兩岸直航港口可行性研究」除對運量推估、靜穩度分析及港區最適配置方案規劃等工程面議題進行分析外，並對效益財務、未來開放民間投資可行性及推動策略等執行面進行研究以供本府制定政策之參考。
針對新竹市提報交通部之「觀光科技港計畫」，交通部於考察後表示支持新竹市推動兩岸通航港口之政策，對於以「民間投資」推動港區建設亦表認同，建議初期先朝「客貨專用區」方向規劃，俟運量達到一定規模後再朝國內商港模式推動。
另有關設置觀光遊艇碼頭部分，新竹市府交通處已於96年完成相關評估，因市場環境不佳，且未達經濟規模，故暫不可行。如有任何改進意見，請email至02573@ems.hccg.gov.tw信箱，或電洽電話：03-5216121 #463。