莫拉克颱風重創南台灣，造成高雄縣、屏東縣重大災害，高雄市長陳菊，基於縣市命運共同體理念，在解除颱風應變中心後，立即成立「南部災害救援中心」，陸續指示各局處成立救災大隊，全力投入其他縣市重建工作。工務局自8月8日起，奉派陸續赴台南市、屏東縣及高雄縣等災區協助重整家園。

工務局表示，除了初期赴台南市與屏東縣東港鎮進行抽水搶救工作外，8月12日成立之屏東縣救災大隊，主要針對萬丹鄉、林邊鄉、新園鄉、東港鎮及枋寮鄉等鄉鎮，進行大型家具廢棄物、家禽屍體、漂流木及淤泥清理與運棄。至8月17日止，計動員106人、調集抽水機4部、車輛3部、挖土機6台、卡車20台、推土機30台、吊臂卡車6台、污泥車4台、水車2台，累計清除垃圾1758公噸、清除土石方1416公噸、清洗災區道路8條。

隨後14日出發的高雄縣救災大隊，則針對甲仙鄉、東安村、關山村、大田村和西安村等村落，進行各村莊民房及道路淤泥清除。至17日止計動員174人、調集挖土機5台、卡車37台、推土機34台、抓斗車10台，累計清除土石方8625公噸、搶通道路12條；目前已完成任務，該局救災人員紛紛回各工作崗位待命。

莫拉克颱風引起「88水災」，造成台灣嚴重災害，部分搶修工作雖已完成，然而後續重建工作，仍是艱鉅任務。相較於南部其他縣市，天佑高雄，讓莫拉克颱風對高雄市的損害較為輕微，但市府秉持「救災一條心、不分你我」理念，伸出雙手提供周邊縣市最大援助，這也是「幸福高雄」的最高精神。