莫拉克颱風過後，氣候酷熱，若未能注意環境清潔及個人的衛生，容易因污染黴菌、細菌等致病原的滋生而引發腸胃疾病，為保護民眾飲食衛生，嘉義市政府衛生局將加強轄內餐飲業食品衛生稽查，尤其針對餐飲業者使用之水源、冷藏食品溫度及原物料保存及調理過程之衛生。
嘉義市政府衛生局呼籲民眾，颱風過後水質混濁，自來水細菌數激增，民眾應注意以下事項：
1.食用食物之前應將手部洗乾淨。
2.燒開水最少要沸騰5分鐘以上，才能夠殺死水中細菌。
3.盡量勿生飲冰塊及冷飲。
4.食品煮熟後再食用，在此期間請儘量選購熱食。
5.發現水質混濁應沉澱後再清洗食品、容器，洗淨之後再用沸水燙過才使用。
6.少數停電地區住戶，應確保食品及原物料保存，以防因高濕度環境而造成食物受黴菌感染。